仓最早的孔庙始建于元代延?二年（1315年）。当时昆山州治迁至因海运而起的太仓，知州王安贞在州治北面建立了“庙学”即孔庙。后昆山州治迁回，庙学即废。明正统元年（1436年），当时的苏州巡抚周忱决定划拨陈门桥东即元水军万户故第（现二招一带）若干土地建立卫学。当时卫学建有明伦堂、大成殿、戟门，忠义二斋等建筑。到明弘治十年（1497年）设太仓州后遂由卫学改为州学，后历经明清多次反复修缮，成为江南一带规模较大的孔庙，可惜该庙已于上世纪70年代末期拆除，仅留下泮池即月亮湖遗迹。