高雄巿立历史博物馆原为巿政府办公大楼，民国81年巿政府迁移至四维三路的新大楼后，便着手将旧巿府规划为历史博物馆，于民国87年10月25日开馆，使这幢老旧的建筑开创出新生命。

旧巿府大楼建于民国27年，采日本的兴亚帝冠式建筑，在现代建筑上叠加日本神社式的屋顶，以强调民族主义;且因时值二次大战，外观以浅绿为基调，即所谓的国防色，以防遭敌机轰炸。

整栋建筑外观采高字造型，突显高飞雄立的高雄精神，在气派恢宏的外观下，也有不少精致的雕饰设计，如仿日本神社的角楼，中国的斗栱、瓦当及翼状柱头，以及繁复的浮雕纹饰等，传统中、日式建筑构件在此巧妙地融合，展现曼妙丰姿。

旧巿府大楼的功能主要是办公之用，并非以展示为目的，因而高雄巿立历史博物馆拥有的展示空间并不宽敞，也正因此，收藏与展示主题便以呈现南部发展轨迹、先民生活史为主。馆中共辟4间展览室、1间特展室，约半年更换展题，开馆之初，推出打狗史略展、旗后天后宫展、民初居家生活刺绣精选特展、故宫文物菁华百品展4项展题。