药王庙始建于明武帝正德年间（1506-1511），距今已有470余年。庙宇背负梁塬，面向馒头山，居高临下，一天星斗清雅。从十八台级而上，便入山门。一院之内，有山门、享殿、前殿、正殿各三间，正殿东侧有湘子祠三间，东西两侧各有龙王庙、土地庙二间，并有禅房、伙房及磨房三间，共占地一亩五分。殿堂依托山势而建，墙垣以庙堂而环，高低层次分明，错落有致。层顶有走兽花脊，殿内雕梁画栋，精美 绝伦。正殿内塑有孙思邈、韦善俊座像，前者朝服衣冠，足旁卧有一虎；后者纶巾道袍，右旁卧一犬（号曰“乌龙”）。

唐代以来陕西省有两位药王，一位孙思邈，耀县人；一位是韦善俊，洛南人。韦善俊生于公元658年，卒岁不详，在京兆生医有名，曾进宫为武则天治病，武封其为宫中太医。但韦善俊不大气愿身居皇宫辞官生医民间，晚年隐居县城西南八公里之南岭，长年种药，详查药性。他长斋奉道，精长桑之术，凡疗民疾，多所痊愈，逝后被群众奉为“药王”。

药王庙建成后，香火久盛不衰。乾隆十一年（1746）的《洛南县志》载：“凡老幼病役者匍匐诣庙，祷辄介愈”。人们感念药王恩德，曾多次捐钱维修庙院，从出土的碑文可见当时盛况。明世宗嘉靖十八年（1539年），由洛南儒学教谕陈遴撰文，以“药王有功德于民则祀之，洛之人不得以淫祠而毁其庙”，树碑一通，立于院内。每年四月八会、清明会、十月太阳会时，山门大开，广为祭拜，善男信女络绎不绝，香火缭绕，庙前唱戏三天，实属乡邑中的盛事。

1983年9月3日，药王庙被县人民政府为县级重点保护文物。