国家级重点文物保护单位。

瞿昙寺始建于明代初年，位于青海省乐都县瞿昙镇，距县城约21公里。这座规模宏大的汉式建筑风格的藏传佛教寺院，是在明王朝扶持藏传佛教以统治藏区的政治背景下，由三罗喇嘛在洪武二十五年(1392年)创建的，明太祖朱元璋于次年以佛祖释迦牟尼的姓氏赐名为“瞿昙寺”,此后又经历永乐、洪熙、宣德各朝钦派太监及匠师扩建。

寺院选建在雄浑而清幽的风水形胜之地，沿着南向偏东的轴线布局，背倚罗汉山，前临瞿昙河，面朝凤凰山，远可望雪山，同自然环境有机和谐地融成一体。寺院原围有土城，形势险固，可惜目前仅存残垣断壁；全寺现占地52亩，建筑面积约1万平方米。建筑组群划分为前院、中院和后院三进院落，中院和后院周匝廊庑；沿着中轴线序列山门、金刚殿、瞿昙殿、宝光殿和隆国殿；两侧对称建有御碑亭、小钟楼、小鼓楼、配殿、香趣塔和大钟楼、大鼓楼等。其中，前区基本呈汉地佛寺“伽蓝七堂”格局。后区巍峨壮丽，冠于全寺的隆国殿，两翼有呈向上朝拱之势连缀 抄手斜廊，还有造型端庄的大钟楼和大鼓楼对峙左右，则明显仿自明代北京紫禁城的奉天殿(太和殿)和两翼抄手斜廊以及文楼(体仁阁)、武楼(弘义阁)的布局意象，堪称明清北京故宫的“活化石”。另外，主体建筑群东北，还有一组两进院的活佛住 所即囊谦，为青海地区民居建筑风格。

瞿昙寺的汉式建筑风格十分典型，在类型众多的藏传佛教寺院中独树一帜，实际也是清代北京和承德等地大量兴建的汉式藏传佛教寺院的先声。其基本完好的的建筑遗存，包括风水格局、廊院、抄手斜廊、建筑彩画、壁画、御碑等等，为古代艺术、文物和建筑史等研究留下了具有重要价值的众多珍贵实物资料 ，也成了为引人入胜的观光旅游胜地。