船政天后宫占地面积7205平方米，建筑总面积1500平方米，门楼高12米，主殿5开间，进深8.3米，总布局为一轴二进二院，一进为门楼，二进为供奉妈祖的中堂大殿。

船政天后宫位于福州马尾婴脰山，清同治七年（1868年）春动建。正殿供妈祖神像，殿上方有同治御赐“德施功溥”及“天上圣母”匾。1929年天后宫改为林孝女祠。

抗日战争后，宫中文物散失严重，1971年天后宫被拆毁。

2006年10月，马尾区政府投资在原址重建福建船政天后宫，建筑主体工程于2008年初竣工。