宋元丰元年（1078年），蒙城县令、秘书丞王竞始建庄子祠，苏轼为记：“庄子蒙人也，尝为蒙漆园吏。没千余岁而蒙未有祠之者，县令、秘书丞王竞始作祠，求文以为记……。”此祠堂建于涡河北岸是县衙东漆园故址中，主要建筑有逍遥堂、梦蝶楼、观鱼台等。每年祭祀，从未间断，至明朝天顺年间被洪水淹没。《庄子祠堂记》收在《苏东坡全集》中。

  明万历八年（1580年），知县吴一鸾于县城东关（今棉麻公司院内）重建。重建的庄子祠堂规模宏大，颇为壮观。有逍遥堂、梦蝶楼、卷篷各三间，首舍三间，鱼池桥一座。左为梦蝶楼，右为观鱼台。逍遥堂居中，堂中塑庄周像，每年春秋祭祀。明崇祯五年（1632年），知县李时芳重修逍遥堂，增建五笑亭，辟池为庄子濠上观鱼园，并新撰《新修庄子祠记》，刻碑立于祠内。门前立丈余高的石碑，镌刻“庄周故里”四个大字。

  今天，宋、明时期的庄子祠均已不在，仅苏轼的《庄子祠堂记》犹存。聘请中国科学院著名古建筑专家张驭寰作总体设计。总占地面积52亩，总建筑面积1086平方米，全祠由祠堂建筑群与万树园两部分组成。中轴线贯穿，将主要建筑放在中轴线上，左右对称，前朝后寝，建筑体量是前低后高，主次分明，长幼有序，门制重重。不仅进入大三门之后，又出现三门制度，如衡门、庄子门、汉阙门。进入这三道门之后，才可看见逍遥堂（大殿）。同时还有左右配门，东西月门，这一大组门制，成为进入庄子祠大殿之前的序曲。步步引人入胜。而且左右有东西万树园，体现自然，有一种自然野趣。此次重建庄子祠，在施工中分为两期建造。第一期的建造项目就有汉围墙东西万树园围墙、大三门、影壁、山门、逍遥堂，现已基本竣工。二期建设项目古衡门，濮池、五笑亭、观台、观鱼桥、梦蝶楼、南华经阁、东西碑廊、道舍、客舍正在筹建之中。