海门口位于剑川坝子的南部剑湖的西南部，剑湖水经海尾河从海门口流出成为黑潓江，最终汇入澜沧江，过去的海尾河，河道曲折，海门口剑湖出水口一带常为浅水的沼泽地。

在海门口遗址考古发掘工地，剥开覆在上部的土层，显露出来的是越来越多的木桩。其中，仅DT1802、DT1803两个探方，在5x20的一百平方米面积内就有木桩近六百棵，平均每平方米六棵。这一奇异的现象最早是在1957年被发现的，随后，在1978年考古人员又在这一区域进行了第二次考古发掘，现在正在进行的是对这一区域的第三次考古发掘。