准噶尔古城遗址位于和布克赛尔蒙古自治县城东南5公里处，距莫特格乡2公里，据历史资料记载，此城建于1636年—1643年，占地面积16.81万平方米，曾一度为准噶尔部的政治、经济、文化、活动中心。 

古城呈方形，边长为414米×414米，高5.2米，上底宽7米，下底宽8米，每一夯段长45米，城四角为半圆形岗楼。墙的方向北偏西20º，北墙保存较好，在北墙中段有一缺口，宽20米，可能是城门，现已成为一条干河床，河床在城内呈“人”字形分布，其首部即在北墙缺口，一条支流伸向西南，一条伸向东南，东墙保存一般，没有城门，南墙正中有一门，保存较好，可以看出痕迹，门洞宽10米。 

该城墙芯为夯筑，其中掺杂有大量的直径约30厘米的赭色石块，夯层厚约15厘米，城墙外皮用土块砌成，土块长43厘米，宽25厘米，厚11厘米。城墙顶部土坯呈灰黑色，至今保存完好。城中主要遗迹都分布在城的中部偏北，其余皆为平地。遗迹主要为建筑遗址，有残垣、有夯土台，其上有筒瓦、瓦当、莲花方砖等，砖瓦上有兽头、花卉、植物等图案装饰。在古城西北角有一残破的藏式佛塔，城内发现有经文、泥制佛像和铜念珠，现仅存一塔基，高约3米。据当地牧民讲，1970年以前此塔尚存高约10米，后被雷击倒。